Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc13D3YV10 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms