Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apba1B2RUJ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms