Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud4B2RRE7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms