Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf1B2RRD7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms