Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scn7aB1AYL1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms