Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms