Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms