Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms