Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms