Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC17A6Q9P2U8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC17A6Q9P2U8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms