Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms