Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BSDC1Q9NW68 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BSDC1Q9NW68 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms