Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREX1Q9NSU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREX1Q9NSU2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518.6 ms