Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A20Q9NP91 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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