Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl1Q9JKV7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms