Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpa33Q9JKA5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms