Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn19Q9ET38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms