Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtofQ9ESF1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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