Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snap29Q9ERB0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms