Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx12Q9ER00 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms