Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Xab2Q9DCD2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.3 ms