Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic1Q9DC16 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms