Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms