Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm5Q9D806 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm5Q9D806 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms