Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms