Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp23Q9CX11 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp23Q9CX11 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms