Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd1Q9CR42 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ankrd1Q9CR42 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd1Q9CR42 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms