Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gkn2Q9CQS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkn2Q9CQS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms