Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2Q9CQP2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms