Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1QTNF1Q9BXJ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF1Q9BXJ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms