Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC106Q9BWC9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC106Q9BWC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms