Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf34Q99KR6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms