Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciao1Q99KN2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ciao1Q99KN2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms