Protein–RNA interactions for Protein: Q99J93

Ifitm2, Interferon-induced transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm2Q99J93 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ifitm2Q99J93 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm2Q99J93 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm2Q99J93 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms