Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED2Q99967 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms