Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC2Q96PR1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms