Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC16BQ96JE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC16BQ96JE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms