Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF428Q96B54 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF428Q96B54 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF428Q96B54 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms