Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC47Q96A33 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms