Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnf144aQ925F3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf144aQ925F3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf144aQ925F3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms