Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep57l1Q8VDS7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms