Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DTX3LQ8TDB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3LQ8TDB6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms