Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C17orf53Q8N3J3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms