Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf9Q8K342 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms