Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1eQ8K202 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms