Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACE1Q8IYU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms