Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS3Q8IXF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms