Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCUBE3Q8IX30 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCUBE3Q8IX30 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms