Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC83Q8IWF9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC83Q8IWF9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms