Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lancl3Q8CD19 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lancl3Q8CD19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms